Plate-forme d’Analyse Bio-moléculaire

Avertissement

Veuillez noter que le service n'est plus disponible. Néanmoins, si vous désirez utiliser ces techniques vous pouvez nous contacter en vue d'une collaboration.

Contact: Prof. Teresa Fitzpatrick

 

 

La plate-forme d’analyse Bio-moléculaire (BMA, pour Bio-molecular Analysis) est un des trois services technologiques du réseau Swiss Plant Science Web (SPSW). Il s'agit de la plate-forme technologique de l’Arc Lémanique Plant Science (ALPS). Celle-ci propose l'expertise et les techniques appropriées pour l’étude des fonctionnalités des bio-molécules. Les services de la BMA sont répartis entre les Universités de Lausanne et de Genève. Les techniques de spectroscopie et de microscopie par transformation de Fourier IR sont mises à disposition à Lausanne. Le service d'analyse des protéines est établi au Département de Botanique et Biologie végétale à l'Université de Genève.

Cette page présente brièvement les services fournis par la plate-forme BMA à Genève. Pour de plus amples informations, voir la description de la plate-forme sur le site web d'ALPS.

BMA

 


 

Services de la plate-forme BMA de Genève

La plate-forme BMA propose les technologies de pointes dédiées à l’analyse protéique. Après une période florissante de la génomique et de la protéomique, l'accent mis sur la caractérisation des systèmes biochimiques est aujourd’hui particulièrement renforcé. Notre plate-forme dispose des technologies pour l’analyse des systèmes protéiques, leurs interactions et complexes. La plate-forme d’Analyse Bio-moléculaire de Genève offre actuellement 3 services principaux:

  1. L'analyse de diffusion de la lumière multi-angles (Multi Angle Light Scattering : MALS)
    La technique de MALS, couplée à la chromatographie d'exclusion stérique, permet de déterminer l'état oligomérique, la masse moléculaire (Mw) et la qualité d'une macromolécule biologique ou de complexes macromoléculaires. L’analyse en MALS est effectuée avec un miniDAWN TREOS (Wyatt Technology).
  2. Calorimétrie à titrage isotherme (Isothermal Titration Calorimetry : ITC)
    L’ITC est une technique non-invasive pour déterminer précisément les paramètres d’interactions moléculaires (enthalpie, entropie, et constante de fixation) entre les protéines, acides nucléiques et autres composés chimiques. Cette méthode est de plus très puissante pour l’analyse de cinétiques enzymatiques. L’analyse en ITC est effectuée avec un iTC200 (Microcal GE Healthcare).
  3. Conseil en expression et purification de protéines recombinantes
    Nous nous proposons d’assister les chercheurs du « Swiss Plant Science Web » pour la préparation d’échantillons de protéines de haute qualité, destinés à l'analyse biophysique par MALS, ITC, et autres techniques de pointe.

 

Formation

La BMA de Genève enseigne les méthodes biophysiques et les stratégies mises en œuvre dans la production de protéines recombinantes. Ces cours sont dispensés aux utilisateurs de la plate-forme ainsi qu’aux étudiants du SPSW. Nous proposons des séminaires sur la plate-forme BMA aux départements membres du SPSW. En 2010 la BMA a visité 8 universités participant au SPSW pour leur présenter une introduction aux services et techniques disponibles à la plate-forme.

Dernier cours:

  • Méthodes biophysiques (ITC, MALS) permettant d'étudier les interactions protéine – ligand
    Date: 25 - 27 avril 2012 (3 jours)
    Lieu: Université de Genève, Science III, Salle 0035

 

Publications

Colinas M., Shaw H.V., Loubery S., Kaufmann M., Moulin M. & Fitzpatrick T.B.: A pathway for repair of NAD(P)H in plants.
J Biol Chem 2014. PMID: 24706747.

Moccand C., Boycheva S., Surriabre P., Tambasco-Studart M., Raschke M., Kaufmann M. & Fitzpatrick T.B.: The Pseudoenzyme PDX1.2 Boosts Vitamin B6 Biosynthesis under Heat and Oxidative Stress in Arabidopsis.
J Biol Chem 2014, 289(12):8203-16. PMID: 24505140.

Moccand C., Kaufmann M. & Fitzpatrick T.B.: It takes two to tango: defining an essential second active site in pyridoxal 5'-phosphate synthase.
PLoS One 2011, 6(1):e16042. PMID: 21283685.

 

Publications reconnaissant avoir réalisé leur analytique à la plate-forme BMA

Huet T., Miannay F.A., Patton J.R. & Thore S.: Steroid receptor RNA activator (SRA) modification by the human pseudouridine synthase 1 (hPus1p): RNA binding, activity, and atomic model.
PLoS One 2014, 9(4):e94610. PMID: 24722331.

Bissig C., Lenoir M., Velluz M.C., Kufareva I., Abagyan R., Overduin M. & Gruenberg J.: Viral infection controlled by a calcium-dependent lipid-binding module in ALIX.
Dev Cell 2013, 25(4):364-73. PMID: 23664863.

Coquille S., Roux C., Mehta A., Begley T.P., Fitzpatrick T.B. & Thore S.: High-resolution crystal structure of the eukaryotic HMP-P synthase (THIC) from Arabidopsis thaliana.
J Struct Biol 2013, 184(3):438-44. PMID: 24161603.

Coquille S., Roux C., Fitzpatrick T.B. & Thore S.: The last piece in the vitamin B1 biosynthesis puzzle: structural and functional insight into yeast 4-amino-5-hydroxymethyl-2-methylpyrimidine phosphate (HMP-P) synthase.
J Biol Chem 2012, 287(50):42333-43. PMID: 23048037.

 

Communiqué de presse

Kaufmann M.: SPSW Technology Platforms — Close Up: Technology Platform Geneva.
Swiss Plant Science Web Newsletter, 2011/1. Link.

 

Acknowledgments

Please do acknowledge the platform with a sentence such as:
Data analyzed in this publication were generated at the Bio-molecular Analysis Platform Geneva (http://biveg.unige.ch/bma).

Also do not forget to send us the references of your new publications!


 

Conseil académique

Prof. Teresa Fitzpatrick, cheffe du groupe Biochimie et Physiologie Végétales à l'Université de Genève.

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