Unité d’Imagerie des Plantes

L’unité d’imagerie des plantes est constituée de :

Dr. Sylvain Loubéry
Biologiste et chargé de cours suppléant
Tél : +41 (0)22 379 65 68
Bureau 2065B
Sciences III

Anne Utz-Pugin
Laborantine
Tél : +41 (0)22 379 30 19
Labo 2065A

 

Nous offrons nos compétences en microscopie pour :

  • la conception d’expériences ;
  • la préparation d’échantillons et l’acquisition d’images ;
  • le traitement et l’analyse des images.

Ces services sont proposés entre autres dans le cadre de collaborations avec les différents laboratoires du département de Botanique et Biologie Végétale.

Nous avons aussi pour objectif de développer de nouvelles approches et de nouvelles méthodes d’imagerie des plantes.

Nous nous chargeons par ailleurs de la formation des utilisateurs sur différents types de microscopes, et assurons l’entretien du parc de microscopes du département de Botanique et Biologie Végétale (3 microscopes à épifluorescence, stéréomicroscopes et microscopes de routine).

Compétences

Nos compétences recouvrent :

 

  • Histologie

 

Colorations topographiques et histochimiques sur du matériel végétal frais (coupes à main levée ou au vibratome) ou fixé et inclus (coupes au microtome).

 

  • Microscopie à fluorescence
    (épifluorescence et confocale)

 

Observation de protéines et de traceurs fluorescents dans des cellules en culture (protoplastes, algues unicellulaires du type Chlamydomonas) ou dans des tissus ou des plantules de tabac et d’Arabidopsis.

Marquages par immunofluorescence sur des plantules d’Arabidopsis et des algues unicellulaires.

 

  • Microscopie électronique

 

Microscopie électronique à balayage pour l’observation des structures de surface de plantes variées, sur échantillons frais ou sur organes fixés et séchés par point critique (critical point drying).

Microscopie électronique à transmission pour la visualisation de l'ultrastructure d'algues unicellulaires, de graines et de différents tissus d’Arabidopsis.

 

  • Traitement et analyse d’images

 

Utilisation d’ImageJ, Photoshop et Illustrator pour le traitement et le montage d’images, et écriture de macros sous ImageJ.

 

L’hybridation in situ sur des embryons d’Arabidopsis est en cours de développement dans notre unité.

Enseignement

Cours 12B013 : Physiologie et morphologie générale – partie végétale

Cours obligatoire de 2ème année en bachelor de biologie.

Cette partie du cours consiste en 10h de cours et 3 après-midis de travaux pratiques consacrés à l’étude et l’observation des différents tissus et organes végétaux.

 

Cours 14B640 : Histologie et imagerie des tissus

Cours à choix de 3ème année de bachelor et de master.

Cours théorique et pratique couvrant les techniques classiques d'histologie ainsi que l'imagerie confocale et le traitement d'images (40h au total).

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